Simona Abbà

Mi occupo di assemblaggio de novo di genomi e trascrittomi di fitoplasmi e dello studio in silico dei meccanismi di interazione vite/fitoplasma tramite un approccio di systems biology. In parallelo, svolgo un parte della mia attività di ricerca in laboratorio occupandomi dello caratterizzazione molecolare e funzionale di una proteina a funzione sconosciuta isolata in Cryphonectria parasitica.

Ultimamente, mi sto interessando alla condivisione open access dei dati di ricerca, collaborando con alcuni colleghi dell’IVV-TO, dell’IPP-TO e del CERIS, allo sviluppo di una piattaforma open source per la digitalizzazione, conservazione e l’accesso libero e senza restrizioni ai risultati e ai dati della ricerca. Per saperne di più su questo progetto, chiamato “V2P2 repository”, clicca qui.

Nel corso del Dottorato di Ricerca, mi sono dedicata allo studio dell’interazione tra pianta e funghi micorrizici (principalmente Tuber borchii). Più recentemente, durante il periodo di post-dottorato, avevo focalizzato la mia attenzione sulla possibilità di impiego del fungo micorrizico ericoide Oidiodendron maius nei processi di biorisanamento ambientale dall’inquinamaneto di metalli pesanti. Questi studi sono stati condotti principalmente con approcci biomolecolari e biochimici, ai quali è stato affiancato l’utilizzo di Saccharomyces cerevisiae come organismo modello per effettuare prove di mutagenesi, analisi fenotipica e studi di interazione proteina/proteina (interattomica).

Articoli:

  • Margaria P., Abbà S., Palmano S. Novel aspects of grapevine response to phytoplasma infection investigated by a proteomic and phospho-proteomic approach with data integration into functional networks. (2013) BMC Genomics, 14:38 doi:10.1186/1471-2164-14-38.
  • Khouja H.-R., Abbà S., Lacercat-Didier L., Daghino S., Dioillon D., Pierre R., Martino E., Vallino V., Perotto S., Chalot M., Blaudez D. (2013) OmZnT1 and OmFET, two metal transporters from the metal-tolerant strain Zn of the ericoid mycorrhizal fungus Oidiodendron maius, confer zinc tolerance in yeast. Fungal Genet Biol., 52:53:64.
  • Abbà S., Vallino M., Daghino S., Di Vietro L., Borriello R., Perotto S. (2011) A PLAC8-containing protein from an endomycorrhizal fungus confers cadmium resistance to yeast cells by interacting with Mlh3p. Nucleic Acids Research, ISSN: 0305-1048, doi: 10.1093/nar/gkr336.
  • Zampieri E, Balestrini R, Kohler A., Abbà S., Martin F., Bonfante P. (2010) The Perigord black truffle responds to cold temperature with an extensive reprogramming of its transcriptional activity. Fungal Genetics and Biology, 48; 585-591.
  • Abbà S., Khouja H.R., Martino E., Archer D.B., Perotto S. (2009). SOD1-Targeted gene disruption in the ericoid mycorrhizal fungus Oidiodendron maius reduces conidiation and the capacity for mycorrhization. Molecular Plant-Microbe Interactions, 22:1412-1421
  • Abbà S., Balestrini R., Benedetto A., Rottensteiner H., De Lucas J.R., Bonfante P. (2007) The role of the glyoxylate cycle in the symbiotic fungus Tuber borchii: expression analysis and subcellular localization. Current Genetics, 52:159-170
  • Montanini B., Gabella S., Abbà S., Peter M., Kohler A., Bonfante P., Chalot M., Martin F., Ottonello S. (2006) Gene expression profiling of the nitrogen starvation stress response in the mycorrhizal ascomycete Tuber borchii. Fungal Genetics and Biology, 43:630-641
  • Favero-Longo S.E., Chiapello M., Gazzola V., Abbà S., Messina A., Perotto S., Piervittori R., Tretiach M. (2006). Indagini biochimiche e biomolecolari sul ruolo dei licheni endolitici Bagliettoa baldensis e Verrucaria marmorea nella dissoluzione delle rocce carbonatiche. Notiziario della Società Lichenologica Italiana, 19:95. ISSN: 1121-9165.
  • Abbà S., Ghignone S., Bonfante P. (2006) A dehydration-inducible gene in the truffle Tuber borchii identifies a novel group of dehydrins. BMC Genomics (rivista online), 7:39. doi:10.1186/1471-2164-7-39
  • Bonfante P., Abbà S., Balestrini R., Faccio A., Gabella G., Mello A., Miozzi L., Vizzini A. (2005) Il contributo della biologia molecolare alla comprensione della diversità genetica e funzionale del tartufo. Informatore Botanico Italiano, 37 (1, B), 700-701.
  • Gabella S., Abbà S., Duplessis S., Montanini M., Martin F., Bonfante P. (2005) Transcript profiling reveals novel marker genes involved in the fruiting body formation in Tuber borchii Eukaryotic Cell, 4: 1599-1602
  • Vallino M., Drogo V., Abbà S., Perotto S. (2005) Gene expression of the ericoid mycorrhizal fungus Oidiodendron maius in the presence of high zinc concentrations. Mycorrhiza, 15: 333-44
  • Lacourt I., S. Duplessis, S. Abbà, P. Bonfante, F. Martin. (2002) Isolation and characterization of differentially expressed genes in the mycelium and fruitbody of Tuber borchii. Applied and Environmental Microbiology, 68: 4574-4582
  • Bonfante Paola, Simona Abbà, Antonietta Mello e Isabelle Lacourt (2002) Tecniche molecolari per la diagnostica e la morfogenesi del tartufo. Annali dell’Accademia di Agricoltura di Torino, 75-85.

 

Capitoli di libri:

  • Perotto S., Martino E., Abbà S., Vallino M (2012). Genetic diversity and functional aspects of ericoid mycorrhizal fungi. In: The Mycota, Volume 9: Fungal Associations. vol. 9, p. 255-285, BERLIN HEIDELBERG:Springer-Verlag, ISBN: 9783642308253
  • Murat, C., Mello, A., Abbà, S., Vizzini, A., Bonfante, P. Edible mycorrhizal fungi: identification, life cycle and morphogenesis (2008) In: Varma, A. (ed.), Mycorrhiza: State of the Art, Genetics and Molecular Biology, Eco-Function, Biotechnology, Eco-Physiology, Structure and Systematics. 3rd ed. Springer, Berlin 707-732. ISBN: 9783540788249

 

Progetti

Pubblicazioni

  • 2013 - Novel aspects of grapevine response to phytoplasma infection investigated by a proteomic and phospho-proteomic approach with data integration into functional networks - Margaria, P., Abbà, S., Palmano, S. - BMC Genomics, 14:38